2034 پس از میلاد. دو سال از خروج Motoko Kusanagi از بخش 9 می گذرد. توگوسا اکنون رهبر جدید تیم است که به طور قابل توجهی پرسنل منصوب شده را افزایش داده است...

سایا یک قاتل خون آشام ژاپنی است که ماموریت بعدی او در دبیرستانی در یک پایگاه نظامی ایالات متحده در دهه 1960 ژاپن است، جایی که او به عنوان یک دانش آموز ظاهر می شود. او از شمشیر کاتانا/سامورایی برای کشتن خون آشام ها استفاده می کند.

"کاندا" رهبر یک گروه موتور سواری است.دوست نزدیک او "تتسو" وارد یک پروژه دولتی مخفی به نام "آکیرا" می شود.او در راهش برای نجات "تتسو" با گروهی از فعالان ضد دولتی،سیاستمداران حریص،دانشمندان بی مسئولیت و یک رهبر نظامی قدرتمند برخورد می کند...

در دهم آگوست سال 2010 کشور ژاپن به دستور امپراتور بریتانیا مورد حمله نظامی قرار می گیرد قوای انگلیس با استفاده از رباط های جدیدی به نام Knightmare Frames که اخیرا تولید کرده اند موفق به اشغال کشور ژاپن می شود آزادی و حقوق مردم از آنها سلب می شود و به کشور اشغالی ژاپن نام منطقه 11 داده می شود . Lelouch پرنس انگلیسی است که بعد از کشته شدن مادرش بنا به دستور پدرش( امپراتور )که او را از خودش نمی داند به ژاپن فرستاده می شود تا شورشیان ژاپنی را سرکوب کند، Lelouch با خود عهد بسته که پدرش را به قتل رسانده و بریتانیا را نابود کند و انتقام مادرش را از قاتلان بگیرد او همچنین قصد دارد دنیایی جدید با قوانین جدیدی به وجود آورد که در این دنیا خواهرش Nunnally با خوبی و خوشحالی زندگی کند. Lelouch قدرتی دارد که به آن Geass اطلاق می شود نیروی مرموزی که به Lelouchاجازه می دهد تا هرکسی را که بخواهد تحت انقیاد خودش در آورد و هر دستوری که بدهد آن شخص بدون چون و چرا اجرا کند.

یک سال از شکست شورشیان «سیاه» و مرگ طبیعی «زیرو» میگذره در منطقه ی 11، بریتانیا پایه ی آموزش اصلاحیه را گذاشته. جایی که اعضای گروه 11 تبدیل به نمادی از نیروی بی رحم شده اند که افکار شورشیان را سرکوب میکنند و جلوی هر شورشی در آینده را میگیرند. «للوچ» دانشجویی که کسی بهش بدگمان نیست، بدون توجه به گذشته ی سرکشش به عنوان زیرو، به صورت اتفاقی به توطئه ای در مورد زندگی خود و زندگی زن مرموزی که وی را «سی . سی » میشناسند، برخورد میکند. زنی که برایش شخصیت واقعی زیرو و هدف فراموش شده اش را آشکار میسازد. للوچ با حمله به مهاجمین و اعلام مجدد خویش به عنوان زیرو، عازم پایان دادن به چیزی میشود که خودش شروع کننده اش بود...

ماجراهای آینده نگرانه یک مامور اطلاعاتی ضد سایبورگ و تیم پشتیبانی او...