بعد از مرگ مادرشان، Alphonse و Edward Elric تلاش میکنند تا با استفاده از دانش ممنوع کیمیاگری او را برگردانند. اما کیمیاگری براساس نظریه داد و ستد یا مبادله برابر عمل می کند و این قانون اساسی در کیمیاگری است یعنی چیزی با ارزش برابر لازم است تا عملیات انجام گیرد و شکستن قوانین نهی شده و تابوی کیمیاگری بهای سنگسنس دارد. Ed یکی از پاهایش را از دست می دهد و Al تمام بدنش را از دست می دهد. Ed توانست روح Al را در داخ یک زره کامل بسیار بزرگ حبس کند که به قیمت از دست دادن بازویش تمام شد. سالها بعد Ed ( با دو عضو مکانیکی ) و Al ( که هنوز در آن زره بدام افتاده است ) خانه دوران کودکی خود را ترک می کنند، هرکدام از آنها فقط به فکر خوشحالی دیگری است. Ed که استعداد ذاتی و مهارب بالایی در کیمیاگری دارد از نظر بین المللی تصدیق می شود و شهرت زیادی بدست می آورد، او بزودی همه جا به " Fullmetal Alchemist " مشهور می شود. هدف اصلی آنها پیدا کردن هرگونه اطلاعاتی درباره سنگ افسانه ای اندیشمند است. با این امید که آن سنگ به آنها اجازه دهد بدنهای قدیمی خود را بدست آورند. تمام امید آنها به آن سنگ اسرار آمیز است که حتی ممکن است وجود نداشته باشد. اما این دو برادر بزودی می فهمند که آنها تنها کسانی نیستند که بدنبال این سنگ قدرتمند می گردند...

در سال 2015 نیمی از جمعیت نژاد بشر مرده اند و بازماندگان با داوری وحشتناکی از طرف موجودات بزرگ و بسیار قدررتمندی بنام Angels روبرو هستند. Angels ها قرار بود که روح انسانهای مرده باشند. اما این تفکر اشتباه است و آنها در دنیایی از توازن و سعادت همیشگی زندگی نمیکنند بلکه آنها در دنیای ما زندگی میکنند آن هم با هدف نابود کردن نسل بشر. ماشینهای بزرگ و زنده ای بنام Evangelion برای مبارزه و کشتن این هیولاها ساخته شده، اما این ماشینها وحشی و رام نشدنی هستند و برای اینکه این ماشینها بدرستی کار کنند باید یک خلبان با جنبه های روحی و روانی مناسب پیدا شود. به این منظور در داخل Tokyo درون مرکز فرماندهی سازمانی مخفی بنام NERV نوجوانهای مناسب را برای این کار انتخاب میکند و آنها را برای خلبانی با این ماشینها تمرین میدهد تا آنها بتوانند با Angel ها مبارزه کنند حتی اگر به قیمت از دادن ذهن و روحشان تمام شود Shinji Ikari که پدرش رئیس تیمی در NERV است که Evangelion ها را تولید کرده برای خلبانی یکی از این ماشینها انتخاب شده است. او تحت فشار زیاد وارد مبارزات و حوادثی میشود که چیزی از آنها نمیفهمد و مجبور میشود که برای پیدا کردن شجاعت و قدرت نه تنها برای مارزه کردن با این هیولاها بلکه زنده ماندن به عمق وجود خودش رجوع کند.

جنگی منظم در گذر زمان سال ها ادامه داشت تا اینکه به تمدن مدرن انسانی رسید ، دو گروه اصلی درگیر در این جنگ وجود داشت ، گروه اول موجوداتی به نام Chiropteran ها بودن که میتونستن ظاهرشون رو شبیه انسان ها در بیارن ، چیروپترها از خون انسان ها تغذیه میکردن و به روش های معمولی از بین نمیرفتن ، گروه دوم سازمانی به نام Red Shield نام داشت که با پیدا کردن راه های غلبه بر چیروپترها قصد نابودی اونها رو داشتن ،Otonashi Saya دختر دبیرستانی ایه که با خانوادش زندگی آرومی داشت تا اینکه حادثه ای زندگی شادش رو بکلی از بین میبره و...

دوازده سال قبل از شروع داستان، روباهی شرور و قدرتمند با 9 دم به نام کیوبی به دهکده ی کونوها حمله می‌کند. هوکاگه چهارم با استفاده از یک طلسم قوی و با قربانی کردن خود موفق می‌شود کیوبی را داخل بدن ناروتوی تازه به‌دنیا آمده زندانی کند.ناروتو پسری یتیم است و اکثر مردم دهکده ی کونوها او را همان کیوبی می‌بینند و از او متنفر هستند. بنا به فرمان هوکاگه ی سوم هیچ‌کس حق ندارد در مورد وقایع رخ‌داده مرتبط با حمله کیوبی حرفی بزند؛ برای همین همسالان ناروتو چیزی در این مورد نمی‌دانند. با این وجود به‌علت رفتار بزرگسالان و تأثیر این رفتار تنفرآمیز بر روی فرزندانشان، ناروتو دوران کودکی خود را بدون هرگونه رابطه ی صمیمانه و دوستی سپری می‌کند. نتیجه این که ناروتو برای جلب توجه دست به انواع شیطنت و خرابکاری می‌زند. در آغاز ناروتو بدترین شاگرد مدرسه ی نینجاها است اما با تلاش زیاد قدرت‌های خودش را افزایش می‌دهد و بالاخره فارغ‌ التحصیل می‌شود. پس از فارغ‌ التحصیلی، نینجاهای مبتدی به گروه‌های سه نفره تقسیم می‌شوند. ناروتو نیز به همراه ساسوکه اوچیها (بهترین شاگرد مدرسه) و ساکورا هارونو (که ناروتو به او علاقه‌مند است) در یک گروه قرار می‌گیرند. تربیت آنها را هم کاکاشی هاتاکه یکی از بهترین نینجاهای کونوها (که همیشه ماسکی بر صورت دارد) به عهده می‌گیرد.

داستان این انیمه در دنیای پس از مرگ اتفاق میفتد. در این دنیا، یک گروه مسلح از دانش آموزان با رهبری دختری به اسم یوری بخاطر زندگی ناراحت کننده ای که در دنیا داشتند تصمیم دارند بر علیه خدا قیام کنند. در مقابل این افراد، موجودی به اسم فرشته وجود دارد که از توانایی های خاصی برخورداره و رئیس شورای دانش آموزیه. هدف این گروه، شکست دادن فرشته و در دست گرفتن دنیاست...

در دنیایی که انسان‌ها و ابرقهرمان‌ها در کنار هم زندگی میکنند، کاراگاه جنایی‌ای که قدرت‌هایش ازش گرفته شده به همراه همکارش مشغول بررسی پرونده‌ایست که ابرانسان‌ها در آن نقش دارند.

در دوران جنگی بزرگ، "جیرو" مشهور به "شمشیر نقره ای"، با "شاه کولوون" جنگیده و او را به همراه بیشتر فرزندانش شکست می دهد. ده سال بعد او به همراه برادر کوچکش "کوتارو" به سمت هنگ کنگ حرکت می کند تا به "منطقه ویژه"، شهری مخفی که در آن خوناشامها زندگی می کنند برسد. آنها متوجه می شوند نقشه ای برای نفوذ به شهر در جریان است و...

اوکیشیما شرایم در کنار یک دریاچه ی بسیار زیبا زندگی میکند.مستخدم شرایم ، کیساراگی سایا با اون و پدرش تادایوشی زندگی میکند. در روز ها اون مثل یک دختر دبیرستانی معمولی در دبیرستان سانابارا زندگی میکند اما در شب ها اون قدرت های ماوراء الطبیعه میگیرد و...

کیریتو پسر برنامه نویسیه که وارد یه بازی اینترنتی به نام Sword Art Online میشه. کایابا آکیهیکو، نابغه ای که بازی رو ساخته، راه خروج همه رو بسته و همه بازیکن ها توی این دنیای مجازی اسیر شدن. هیچ راه فراری وجود نداره و بازیکن ها وقتی به دنیای واقعی بر میگردن که بازی رو تموم کنن و تمام 100 تا غول این دنیا رو بکشن. و اگر کسی توی بازی کشته شه و ببازه، تو دنیای واقعی هم میمیره . کیریتو که یکی از کسایی بوده که بازی رو توی مرحله ساختش داوطلبانه تست میکرده، تا حدودی چم و خم این دنیا رو میدونه و تصمیم میگیره سولو پلبر (بازیکن مستقل) بمونه و خودش بازی رو تموم کنه و هر وقت هم کسی ازش کمک خواست، بهش کمک کنه. بقیه بازیکن ها هم واسه خودشون گروه و فرقه تشکیل میدن و برای تموم کردن بازی تلاش میکنن.

در دنیای این انیمه دنیایی دیگر وجود دارد که شیاطین در آن دنیا زندگی میکنند. دنیای انسان ها و شیاطین از یکدیگر جدا هستند ولی به وسیله ی دروازه ای به هم متصلند. هیچ موجودی نمی تواند از دنیایی به دنیای دیگه بره ولی شیاطین به وسیله ی تسخیر اشیاء، انسان ها، و سایر موجودات می توانند به دنیای انسان ها بیاند. هر کدوم از این دنیاها هم اسم خاص خودش رو داره.