داستان قسمت سوم درست از جایی شروع می‌‌شود که قسمت دوم(ارباب حلقه‌ها: دو برج) تمام شده بود.اِنت‌ها از برج آیزنگارد محافظت می‌کنند و فرودو (الیجا وود) و سام (شون آستین) که توسط گالوم هدایت می‌‌شوند در بیابان داگورلد(میدان نبرد) هستند، و این در حالی است که حلقه از گردن فرودو آویزان است. او با سام راه کوه هلاکت را در پیش گرفته و سنگینی حاصل از مسئولیتی را که حلقه روی دوشش گذاشته است را احساس می‌‌کند. آنها باید به کوه هلاکت بروند چرا که حلقه در آنجا به وجود آمده ودر آنجا هم باید از بین برود. که ناگهان با تاریکی هوا مواجه می‌‌شوند و باید از گالوم که یکی ار حمل کننده‌های سابق حلقه بوده است و اکنون چهره‌اش تغییر یافته کمک بگیرند...

این فیلم اولین بخش از داستان سه قسمتی Lord of the Rings بوده و داستان Frodo Baggins می باشد که برعلیه Sauron Dark Lord نبرد می کند تا زمین را از فراگیر شدن شرارت نجات دهد. در این سه قسمت ، Frodo و رفقایش در یک سفر سخت و طاقت فرسا سوار بر یک کشتی قصد دارند زمین را از منبع قدرت Sauron که یک حلقه جادویی است ، نجات دهند .“فرودو بگینز” ساکنِ هابیت “زمین میانی”، پی برده حلقه ای که خویشاوند خیّر و عزیزش، “بیلبو” برای اش به ارث گذاشته، در واقع “حلقه ی یکتا” است؛ وسیله ای که به صاحب اش اجازه می دهد قدرت های ظلمانی را به کار بگیرد و دنیا را به اسارت بکشاند. “گَندالف جادوگر” به “فرودو” مأموریت می دهد تا حلقه را به “کوهستان شوم” برگرداند؛ همان مکان ترسناکی که هزار سال پیش، حلقه در آن جا ساخته شده و تنها جایی است که می توان نابودش کرد. در این سفر، هشت رهرو، “فرودو” را همراهی می کنند…

داستان دو برج در پی یاران حلقه رخ می دهد که حول سه محور می چرخد. در یک سو فرودو و سم به سفر خود بسوی موردور جایگاه سارون ادامه می دهند تا حلقه را نابود کنند. در دیگر سو آراگون و همراهانش به سرزمین جنگ زده ی روهان می رسند و همرا با گاندولف آماده ی نبرد هلمز دیپ می گردند و در سوی دیگر مری و پیپین از بند می گریزند و همراه با تری بیرد نقشه ی حمله به ایزنگراد را می ریزند ...

داستان فیلم ، به وقایع و چگونگی زندگی آراتورن ، پدر آراگورن (ارباب حلقه‌ها) ، و به نبردهای پراکنده او در غرب سرزمین میانه با اورک ها می پردازد ...

یاران حلقه با هم متحد شده و سفری را برای نابودی حلقه یگانه ارباب تاریکی آغاز می کنند، تا او را شکست داده و سرزمین میانه را نجات دهند...