در شب کریسمس، یک خلبان جنگنده در راه بازگشت به خانه، در میانه پرواز بر فراز آب گم می شود و برای فرود ایمن به معجزه نیاز دارد.

پدینگتون که توانسته بعد از گذراندن ماجراهای قسمت اول ، در خانواده‌ی براون جایگاهی برای خودش پیدا کند ، اکنون در تلاش است تا با انجام دادن شغل‌های مختلف ، پولی پس‌انداز کند تا هدیه‌ای ویژه برای جشن تولد 100 سالگی عمه‌اش بخرد. اما…

داستان گروهی از ماموران پلیس که با استفاده از ابزار دست ساز خود به شکار ارواح سرگردان در کلیساهای تسخیرشده، زیرزمین ها و دخمه ها و نیز بیمارستان های متروکه میپردازند.