داستان 6 ماه پس از وقایع سری 12 قسمتیِ انیمه Blood C هست که فومیتو فرار میکنه به توکیو و سایا هم دنبالش اومده و ...

داستان از آنجا آغاز می شود که سرگرد موتوکو کوسانگی در پی یافتن حقیقت در مورد قتل مرموزانه کارآگاه ارشد میباشد. او به شدت مشغول جمع آوری اطلاعات و مدارک در این باره میباشد تا اینکه به قضیه ایی عجیب بر میخورد...

اوکیشیما شرایم در کنار یک دریاچه ی بسیار زیبا زندگی میکند.مستخدم شرایم ، کیساراگی سایا با اون و پدرش تادایوشی زندگی میکند. در روز ها اون مثل یک دختر دبیرستانی معمولی در دبیرستان سانابارا زندگی میکند اما در شب ها اون قدرت های ماوراء الطبیعه میگیرد و...

جنگی منظم در گذر زمان سال ها ادامه داشت تا اینکه به تمدن مدرن انسانی رسید ، دو گروه اصلی درگیر در این جنگ وجود داشت ، گروه اول موجوداتی به نام Chiropteran ها بودن که میتونستن ظاهرشون رو شبیه انسان ها در بیارن ، چیروپترها از خون انسان ها تغذیه میکردن و به روش های معمولی از بین نمیرفتن ، گروه دوم سازمانی به نام Red Shield نام داشت که با پیدا کردن راه های غلبه بر چیروپترها قصد نابودی اونها رو داشتن ،Otonashi Saya دختر دبیرستانی ایه که با خانوادش زندگی آرومی داشت تا اینکه حادثه ای زندگی شادش رو بکلی از بین میبره و...

ماجراهای آینده نگرانه یک مامور اطلاعاتی ضد سایبورگ و تیم پشتیبانی او...