داستان در سرزمین لوسیس اتفاق می‌افتد که یک کریستال مقدس در آن وجود دارد و لشکریان امپراطوری سعی دارند تا آن را تصاحب کنند و ...

پس از وقایع داستان اول، قهرمانان ما در تلاش برای داشتن یک زندگی عادی هستند و به روال قبلی زندگی خود باز می گردند.

داستان از این قرار است که یک نوع بیماری وارد زمین شده و کودکان به آن مبتلا شدند در این حین افرادی کودکان را جمع آوری میکنند و به آنان می گویند که میتوانند بیماری زخم کیهانی را درمان کنند و سپس آنان را به چشمه ای میبرند و به همه میگویند از آبی که خاصیت تلسم کردن را دارد بنوشند تا آنان را سربازان خویش کنند. در این حین شخصیتی به نام کلود که خود را مسئول این اتفاق میداند برای نجات کودکان به دنبال آنان میگردد...

انیمیشن (Last Order) حدودا نیم ساعته اتفاقات 5 سال قبل از بازی اصلی (Final Fantasy VII) را به طور فشرده و کوتاه توضیح داده. در واقع مربوط به جایی میشود که Cloud و Zack در حال فرار بودند ...