سی سال بعد از حمله هیولای اصلی، یک "گودزیلای" جدید به ژاپن حمله می کند...

دولت ژاپن اخبار وحشتناک گودزیلا را مخفی می کند زیرا تنش های سیاسی بین ایالات متحده و اتحاد جماهیر شوروی افزایش می یابد و هر دوی آنها برای متوقف کردن هیولا، مایل به بمباران ژاپن هستند.

زمین توسط فضاپیمای بیگانه از زهره مورد حمله قرار می گیرد. اما یک دانشمند ژاپنی یک کاردستی فضایی به نام Gohten ساخته است که با آن او می تواند بشریت را نجات دهد.