داستان فیلم پس از اتفاقات قسمت اول جریان دارد که در پایان آن مشاهده کردیم که گلرت گریندل‌والد با کمک نیوت اسکمندر دستگیر شد. با این حال ، گریندل‌والد موفق شده از زندان فرار کند و در حال جذب طرفداران بیشتری برای خود است. داملبدور در تلاش است تا برنامه‌ها و نقشه‌های گریندل‌والد را خنثی کند و در این راه کمک نیوت اسکمندر ، شاگرد سابقش در مدرسه هاگوارتز را قبول می‌کند. اما این ماموریت ساده‌ای نخواهد بود و آنها از خطراتی که این ماموریت دارد ، آگاه هستند و…