داستان فیلم درباره‌ی یک افسر ارتش میباشد که وظیفه‌ی اسکورت کردن یک سرخ‌پوست را برای بازگشت به سرزمینش در سال 1892 بر عهده می‌گیرد. اما…

داستان قسمت دوم فیلم روز استقلال ، 20 سال پس قسمت اول اتفاق می‌ افتد. انسان‌ ها بعد از شکست دادن بیگانگان در قسمت قبل ، از تکنولوژی‌ های آنها استفاده کردند تا به پیشرفت‌ های تکنولوژیکِ دست پیدا کنند و این مساله باعث خشمگینی بیگانگان شده است و آنها برای باز پس گرفتن تکنولوژ یشان خود دوباره به زمین حمله می کنند و…