داستان این فیلم ماجرای قهرمان جدیدی است که سرگذشتش از سه قسمت قبلی سری بورن نشات می گیرد...

سم فلین که پسر کلوین فلین است، به فناوری که بیست و پنچ سال پیش از این پدرش از آن استفاده کرده، دست یافته است. سم متوجه میشود که پدرش ناپدید نشده و همه این سال ها را در این بازی زندگی کرده. سم برای نجات پدرش به داخل بازی نفوذ کرده و...