داستان بر جنگ جام مقدس متمرکز است و رابطه بین شیرو امیا و ساکورا ماتو، دو نوجوان شرکت کننده در این درگیری را بررسی می کند...

زمانی که “شیرو” 7 سال داشت، در آتش سوزی ویرانگر که شهر Fuyuki را نابود کرد خانواده خود را از دست داد و از نظر ذهنی آسیب شدیدی را متحمل شد. شیرو توسط جادوگری به نام Kiritsugu Emiya نجات پیدا کرد و تحت سرپرستی او قرار گرفت...

این انیمه اقتباسی از یک داستان جانبی از مجموعه رمان های کارا نو کیوکای است که به دو قسمت تقسیم می شود. حلقه موبیوسپ روانشناسی هستند که می توانند آینده را ببینند.

هفت جادوگر منتخب و ارواح قهرمان احضار شده آنها با یکدیگر مبارزه می کنند تا جام مقدس را به دست آورند: وسیله ای جادویی که می تواند هر آرزویی را برآورده کند.