گروهی از دخترانی که مجذوب «سیستم مادی تئاتر» شده‌اند، پس از ناپدید شدن یک شهر کامل، رویای حضور روی صحنه را دنبال می‌کنند. سرنوشت آنها چگونه به هم گره خواهد خورد؟

300 سال پس از جنگ فاجعه، گروهی متشکل از مبارزان آزادی و لباس‌های متحرک باستانی یک بار برای همیشه به دادخواهی برمی‌خیزند.

ملکه دوم زنی نیزه دار را استخدام می کند تا پسرش را از دست میکادو (امپراتور) نجات دهد که معتقد است شاهزاده جوان توسط یک دیو آب تسخیر شده است که پیش بینی شده بود در صورت زنده ماندن او خشکسالی وحشتناکی را بر روی زمین بیاورد.

جنگی منظم در گذر زمان سال ها ادامه داشت تا اینکه به تمدن مدرن انسانی رسید ، دو گروه اصلی درگیر در این جنگ وجود داشت ، گروه اول موجوداتی به نام Chiropteran ها بودن که میتونستن ظاهرشون رو شبیه انسان ها در بیارن ، چیروپترها از خون انسان ها تغذیه میکردن و به روش های معمولی از بین نمیرفتن ، گروه دوم سازمانی به نام Red Shield نام داشت که با پیدا کردن راه های غلبه بر چیروپترها قصد نابودی اونها رو داشتن ،Otonashi Saya دختر دبیرستانی ایه که با خانوادش زندگی آرومی داشت تا اینکه حادثه ای زندگی شادش رو بکلی از بین میبره و...

بعد از مرگ مادرشان، Alphonse و Edward Elric تلاش میکنند تا با استفاده از دانش ممنوع کیمیاگری او را برگردانند. اما کیمیاگری براساس نظریه داد و ستد یا مبادله برابر عمل می کند و این قانون اساسی در کیمیاگری است یعنی چیزی با ارزش برابر لازم است تا عملیات انجام گیرد و شکستن قوانین نهی شده و تابوی کیمیاگری بهای سنگسنس دارد. Ed یکی از پاهایش را از دست می دهد و Al تمام بدنش را از دست می دهد. Ed توانست روح Al را در داخ یک زره کامل بسیار بزرگ حبس کند که به قیمت از دست دادن بازویش تمام شد. سالها بعد Ed ( با دو عضو مکانیکی ) و Al ( که هنوز در آن زره بدام افتاده است ) خانه دوران کودکی خود را ترک می کنند، هرکدام از آنها فقط به فکر خوشحالی دیگری است. Ed که استعداد ذاتی و مهارب بالایی در کیمیاگری دارد از نظر بین المللی تصدیق می شود و شهرت زیادی بدست می آورد، او بزودی همه جا به " Fullmetal Alchemist " مشهور می شود. هدف اصلی آنها پیدا کردن هرگونه اطلاعاتی درباره سنگ افسانه ای اندیشمند است. با این امید که آن سنگ به آنها اجازه دهد بدنهای قدیمی خود را بدست آورند. تمام امید آنها به آن سنگ اسرار آمیز است که حتی ممکن است وجود نداشته باشد. اما این دو برادر بزودی می فهمند که آنها تنها کسانی نیستند که بدنبال این سنگ قدرتمند می گردند...