داستان سریال "آکادمی آمبرلا" حول گروهی با قدرت‎های عجیب و غریب روایت می‌شود که همگی به طور غیرعادی به دنیا آمده‌اند و به سبب توانایی‌های ذاتی‌ای که در اختیار دارند، تحت سرپرستی شخصی به نام "رجینالد هارگریوز" درمی‌آیند. اما پس از اینکه هارگریوز به طرز مشکوکی کشته می‌شود، آنها تصمیم می‌گیرند تا به کمک همدیگر پی به راز مرگ رییس خود ببرند و همچنین دنیا را هم نجات دهند و...